英國新冠病毒變種正式名稱:SARS-CoV-2 VOC 202012/01 ( VOC:variant of concern 或 VUI:Variant Under Investigation, year 2020, month 12, variant 01)。主要流行於倫敦及東南英格蘭,目前澳洲、丹麥、義大利、冰島、荷蘭也都有病例,感染民眾目前統計起來較年輕,大部分都小於60歲 (平均:41歲),美國還沒有發現這類病毒,但也有可能是只有少部分的感染個案有作基因定序。
病毒恐怖的突變適應能力
SARS-CoV-2每兩個禮拜就可以有新突變,但大部分是產生不會造成胺基酸改變的同義突變 (Synonymous),當然也會產生非同義突變 (Non-synonymous),這種類型胺基酸就會產生改變,不過也不是每種非同義突變都會改變整個蛋白質功能。
英國的新型變種病毒 (VOC 202012/01) 有重要的14種非同義突變、3種缺失突變 (deletions),還有相較不重要的6種同義突變。以下列舉重要的突變:deletion 69-70, deletion 144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H。
重要的基因突變
N501Y是最重要的突變,因為它改變了與宿主細胞結合的棘蛋白部位 (Receptor binding domain of the spike protein at position 501),其中胺基酸的asparagine (N)改成tyrosine (Y),造成與ACE2 receptor鍵結更強 (human angiotensin-converting enzyme 2),使得病毒更容易進入細胞內,目前雪貂動物實驗中發現,傳染力的確因為N501Y突變而因此上升。另外南非在2020年11月18日也有發表聲明出現N501Y突變的冠狀病毒,但科學家發現是和英國這支是不同來源的。
H69/V70這兩種缺失突變也很重要,因為造成棘蛋白的其中部分去除了,所以整體形狀長得不一樣,造成我們免疫細胞的辨識能力下降,單株抗體的治療效果也因此下降。
P681H也是棘蛋白中Receptor binding domain有意義的突變。
新型冠狀病毒變種的影響
■傳播力更強:
■疾病嚴重度:
■重複感染:
■疫苗效果:
■實驗檢測:
結論
每次在讀病毒微生物的時候,都會感嘆他們突變與適應力真的很強,像這次的新型冠狀病毒就不斷找到生命的出路,改變自己的棘蛋白增加自己的傳染力,甚至逃避免疫系統的追擊,有種我們人類在怎麼研究追趕都無能為力的感覺。我想我們能做的也最有效益的,還是從最基本的防疫手段開始:洗手、戴口罩、避免去人多場合、有呼吸道症狀請自我做好健康管理,還有全力配合中央流行疫情指揮中心的宣導,持續關心疫情訊息,最後希望台灣可以平安度過這次考驗,大家一起加油!台灣加油!
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Reference
1. Implications of the Emerging SARS-CoV-2 Variant VOC 202012/01. Centers for Disease Control and Prevention. Updated Dec. 22, 2020.
2. SARS-CoV-2 Variant – United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland. World Health Organization. Updated Dec. 21, 2020.
3. Rapid increase of a SARS-CoV-2 variant with multiple spike protein mutations observed in the United Kingdom. European Center for Disease Prevention and Control. Updated Dec. 20, 2020.